در پی شکایت سازمان بازرسی کل کشور از بنیاد مسکن انقلاب اسلامی و درخواست ابطال تبصره ۳ بند ۷ شیوه نامه تفاهم با مالکین متقاضی تفکیک اراضی روستایی بنیاد مسکن انقلاب اسلامی در خصوص تملک اراضی روستایی، هیأت عمومی دیوان عدالت اداری اخذ درصد از اراضی روستایی متقاضی تغییر کاربری بوسیله بنیاد مسکن را خارج از حدود اختیارات قانونی دانست و آن را ابطال کرد.
متن تبصره ۳ ماده ۷ شیوه نامه یاد شده از این قرار است: «هرگونه اقدام اجرایی در زمینه تهیه یا اصلاح طرح روستا جهت تغییر کاربری یا ورود اراضی فوق به محدوده روستا، صرفا پس از تعیین درصد سهم طرفین (مالک و بنیاد) و امضای صلح نامه (صلح معوض) از سوی طرفین مجاز خواهد بود».